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Sélection Génomique Holstein
Par rapport à la sélection génétique classique basée sur le testage sur descendance,
l’analyse génomique offre de nombreux avantages concrets, notamment au niveau des
caractères fonctionnels et de la modernité des pedigrees. Actuellement basée sur
la Sélection Assistée par Marqueur (SAM), l’analyse génomique s’orientera très prochainement
vers la Sélection Génomique.
La Sélection Assistée par Marqueur (SAM)
Commencée en 2001, c’est un programme national de recherche appliquée qui permet
de prédire le potentiel génétique d’un animal grâce à l’étude de son ADN.
La technique SAM s’appuie sur la détection de régions chromosomiques appelées QTL
(Quantitative Trait Locus). Ces QTL sont connus pour avoir une influence sur des
caractères d’intérêt chez les bovins laitiers. Ces régions chromosomiques contiennent
plusieurs marqueurs identifiés grâce à la technique des puces à ADN. Par la détection
de ces marqueurs, on en déduit la présence des QTL et on peut, ainsi, calculer l’index
génomique d’un animal.
L’évaluation de la valeur génétique d’un animal grâce à la technique SAM inclut
toutes les informations disponibles sur l’animal afin que l’index soit le plus fiable
possible.
- L’ascendance
- L’information génomique recueillie grâce aux marqueurs
- Les performances de l’individu ou de ses filles quand elles existent
Grâce à la génomique, vous bénéficiez de la génétique Holstein la plus moderne,
sélectionnée parmi les meilleurs reproducteurs.
La SAM permet une évaluation génétique précoce des jeunes animaux avec une fiabilité
élevée. Le CD des index SAM varie entre 0,48 et 0,65, pour le moment, et augmentera
prochainement. La précision de la SAM sera fortement augmentée en la combinant avec
la Sélection Génomique.
Demain, la Sélection Génomique (SG)
La Sélection Génomique est une méthode d’évaluation génétique des animaux grâce
à leur ADN (suite à un prélèvement biologique de type sang, poils ou biopsie), qui
utilise un nombre très élevé de marqueurs couvrant l’intégralité du génome.
A la différence de la SAM, la Sélection Génomique ne prend pas en compte les régions
chromosomiques (QTL) mais étudie les marqueurs un par un. Grâce à leur détection,
on peut calculer l’index d’un animal.
L’efficacité de la Sélection Génomique est avérée dès lors que l’influence d’un
marqueur (sur des caractères bien précis) est démontrée et établie sur la base d’une
population de référence.
Combinaison de la SAM et de la Sélection Génomique
En France, l’objectif est de combiner les deux méthodes d’évaluation.
On tirera le maximum de profit avec la SAM pour identifier les QTL et avec la SG
pour identifier les marqueurs individuellement.
Cette approche apportera une précision maximale et pourrait être mise en œuvre très
prochainement en France.